В соответствии со статьей 7 Договора о дальнейшей деятельности Кыргызско-Турецкого университета "Манас" от 26 апреля 2011 года учебная, административная и финансовая деятельность университета, а также финансовые расходы и другие виды деятельности Попечительского совета контролируются Ревизионной комиссией. Ревизионная комиссия состоит из 8 человек по 4 человека с кыргызской и турецкой сторон. Члены Ревизионной комиссии с кыргызской стороны назначаются постановлением Правительства Кыргызской Республики. Председатель Ревизионной комиссии назначается из числа членов комиссии по взаимному согласованию сторон сроком на 2 года поочередно с каждой стороны. Срок полномочий членов Ревизионной комиссии 5 (пять) лет.
Проф., док. Нажи Гундоган
председатель Ревизионной комиссии,
член исполнительного совета высшего образования Турецкой Республики
Жабудаев Турукмен Жусупбекович
член Ревизионной комиссии,
Начальник Управления науки Кыргызской Республики
Эржан Өзкан
член Ревизионной комиссии,
Абазов Муктарбек Акынбекович
член Ревизионной комиссии,
начальник отдела местных налогов управления Государственной налоговой службы при Министерстве финансов Кыргызской Республики по контролю за крупными налогоплательщиками по городу Бишкек и Северному региону
Проф. док. Осман Карамустафа
член Ревизионной комиссии,
Камчыбеков Алик Шейшенканович
член Ревизионной комиссии,
начальник отдела аудита Службы внутреннего аудита при Министерстве финансов Кыргызской Республики